La segunda parte contempla las leyes generales de Instituciones y procedimientos electorales; de Partidos Políticos; de Medios de impugnación en materia electoral y la Ley orgánica del Poder Judicial de la Federación.
El INE señaló que la controversia está articulada en cuatro ejes:
- El primero, es la violación al debido proceso legislativo por parte del Congreso de la Unión.
- En segundo término, la vulneración a la autonomía e independencia del Instituto por parte de los poderes Legislativo y Ejecutivo.
- En tercer punto, la vulneración a las condiciones de equidad y de otros principios que deben regir las contiendas electorales, ya que esta reforma contiene cambios que afectan la certeza en los procedimientos que conforman el proceso electoral en sus diversas etapas.
- En cuarto punto la afectación inconstitucional de los derechos laborales del personal del INE que provoca dicha reforma.
